เรื่องย่อ : ยอดนักสืบจิ๋วโคนัน เดอะมูฟวี่ 9 ตอน ยุทธการเหนือห้วงทะเลลึก โคนัน รัน และโมริ โคโกโร่ ได้รับเชิญจาก โซโนโกะ เพื่อนสนิทของรันให้เข้าร่วมการเดินทางครั้งแรกของเรือสำราญหรูหรา อะไฟรไดท์ ที่จะล่องสู่มหาสมุทรแปซิฟิค โดยที่สมาชิกที่จะเข้าร่วมในการเดินทางครั้งนี้ได้ ต้องเป็นนักการเมืองกลุ่มทุนไฟแนนซ์หรือกลุ่มสังคมชั้นสูงเท่านั้น เพื่อที่จะได้เป็นการเดินทางที่มีสีสันเหมาะสมกับชื่อของเรือที่หมายถึงเทพธิดาแห่งความงามอะโฟรไดท์นั่นเอง และได้เกิดเหตุฆาตกรรมต่อเนื่องขึ้นบนเรือ ซึ่งคนร้ายได้ใช้ระเบิดเดิมพันกับผู้โดยสารกว่า 600 ชีวิต รันโดนจับตัวไว้!! โคนันและโมริ โคโกโร่ จะสามารถหยุดยั้งแผนการณ์ของคนร้ายและช่วยรันออกมาได้อย่างปลอดภัยหรือไม่!? ความผูกพันระหว่างรันและชินอิจิ ณ ช่วงเวลานั้นจะเป็นเช่นไร!?